Приграничный город противник захватил в первые часы войны. Несмотря на это, гарнизон Брестской крепости под командованием капитана Ивана Зубачева и полкового комиссара Ефима Фомина в течение недели геройски сдерживал натиск врага. Отдельные очаги сопротивления оставались в крепости до конца июля и даже до начала августа 1941 года.

Более трёх лет Брест находился в оккупации. Свыше 40% населения города в начале Великой Отечественной войны составляли евреи. Практически сразу здесь начались массовые расстрелы, а в декабре 1941 года было создано Брестское гетто, которое просуществовало до осени 1942 года. В октябре 1942 года оккупационные власти ликвидировали гетто. Согласно историческим источникам и документам, из почти 20 тысяч узников удалось спастись лишь 19.

Всего с июня 1941 года по июль 1944 года в городе было убито около 40 тысяч человек.

28 июля 1944 года в ходе проведения Люблинско-Брестской операции Брест освободили войска 1-го Белорусского фронта, которым командовал маршал Советского Союза Константин Рокоссовский.